SMK Pertanian dengan lima kompetensi program keahlian yaitu Agribisnis Tanaman Perkebunan, Agribisnis Pembibitan dan Kultur Jaringan, Agribisnis Ternak Unggas,Mekanisasi Pertanian, dan Teknologi Pengolahan Hasil Pertanian SMK Negeri 3 Penajam Paser Utara berdiri sejak Tanggal 26 November 2008 yang berorientasi dalam rumpun Agribisnis dan Agrondustri.
